针对249个问题的整改工作，五部委办已经印发了有针对性的指导意见。
何建中表示，收费公路专项清理取得了六大成效：
一、撤销和调整了328个存在间距不合理、间距过近等问题的收费站，停止收费的公路里程3706公里；
二、有182个收费公路项目降低了通行费标准，其中上海、江苏、山东、湖南降低了所有高速公路以及桥隧的最低收费标准，北京、南京、南昌、武汉等地降低了机场高速公路通行费标准；
三、取消了58个收费期限届满、己经还清贷款与集资款、以及里程规模不符合规定要求的收费公路项目；
四、规范了158个原经依法批准、但收费年限累计总和超过《收费公路管理条例》规定最长期限的问题；
五、废止或修订了7个与国家现行行政法规存在不一致的地方性的规章和文件；
六、积极推进取消普通公路收费。如云南省从今年1月1日起全部取消了政府还贷二级公路收费，这在西部省份也是比较早的，撤销收费站184个，减少收费公路里程10016公里。
多省市积极开展收费公路专项清理工作
何建中在例行发布会上指出，陕西省从今年年初撤销了33个政府还贷二级公路收费站，剩下70个宣布在今年内全部撤销。
江西省已经制定出台了取消全省普通公路收费实施方案。其中既包括2009年已经取消政府还贷二级公路收费的收费站，同时从今年3月1日起，首先取消了由省级部门管辖的12个政府还贷一级公路收费项目；计划到2013年年底，全部取消一级公路收费和经营性二级公路收费。
河南省也提出了一些具体的措施，推动经营性普通收费公路回归公益属性，鼓励地方政府在年底前回购经营性普通公路，回购以后取消收费。