事中事后监管形成制度
为确保下放事项的审批不变形、不走样，自治区交通运输厅成立了推行政府部门权力清单制度工作领导小组，认真做好权力清单、责任清单梳理分类及事中事后监督管理制度制定工作。
针对已经取消和下放的行政审批事项，自治区交通运输厅组织人员，制定了下放审批事项事中事后监管制度，确保每个下放事项有切实可行的监管措施。管理方式从注重事前审批向注重事中、事后监管转变，采用自查、互查、抽查、约谈等方式，进行定期和不定期检查，加大监管力度。
2014年至今，自治区交通运输厅政务服务窗口协助配合基层执法部门查处了多辆使用虚假材料办证的不可解体货物运输车辆，并把42名相关违法人员列入“黑名单”，取消其1年或3年内申请办理行政许可证件的资格，维护了行政审批秩序。
群众满意度达100%
2007年9月自治区政务服务中心成立后，自治区交通运输厅机关、港航管理局、道路运输管理局、公路管理局、高速公路管理局、交通工程质量安全监督站等6家单位以自治区交通运输厅的名义整体进驻，统一受理和办理行政审批业务。
自治区交通运输厅及各直属机构机关内部不再直接受理审批业务，做到严格禁止行政审批项目“体外循环”和“两头受理”，所有审批工作实行首问负责制、限时办结制、责任追究制，接受上级部门和社会的监督。数年来，政务服务窗口工作人员在审批过程中没有发生吃、拿、卡、要等不廉洁行为。
2007年以来，自治区交通运输厅政务窗口每年受理的行政审批事项在1.5万件左右，所有审批事项均在承诺时限内办结，群众评议满意度达到100%。2009年至2014年，连续6年获评自治区政务服务先进单位。