根据备忘录，广深港高铁香港段开通初期，每日计划开行１２７对列车，其中短途列车１１４对，长途列车１３对。短途列车往返香港西九龙站、福田站、深圳北站、虎门站及广州南站。长途列车则可直达北京、上海、昆明、桂林、贵阳、石家庄、郑州、武汉、长沙、杭州、南昌、福州、厦门及汕头等城市。双方同意将来可按实际需要协商调整列车开行方案。
在票价方面，双方商定过境列车按照“分段计费、各自定价、加总核收”的原则定价，即广深港高铁内地段及香港段将分别各自确定价格，跨境高铁的总票价是两段高铁票价的总和。香港方面将参考人民币票价以港币标价，票价会根据市场实际情况调整。香港特区政府运输及房屋局局长陈帆日前透露，从香港西九龙站到深圳福田票价为８０港元、到深圳北站为９０港元、到虎门为２１０港元、到广州南站为２６０港元。
香港特区行政长官林郑月娥表示，备忘录的签署标志香港特区政府与中国铁路总公司就广深港高铁各项财务及运营事宜已达成原则性共识，为高铁香港段能够顺利在第三季开通以及日后畅顺运作，奠定良好的基础。双方同意加快推进高铁香港段各项运营的准备工作，开通后实现与全国高铁网络的互联互通，有助香港与内地各大城市之间加强交流，促进优势互补。
中国铁路总公司总经理陆东福表示，中国高铁已达２．５万多公里，占世界高铁的６６％以上。广深港高铁是全国高速铁路网的重要组成部分，实现广深港高铁与内地高铁网互联互通，是中央对香港繁荣发展的重视、支持，让香港市民分享全国高铁发展成果。
陈帆在签署备忘录后与传媒会面时表示，目前已与中国铁路总公司就如何分账有初步共识，双方在分账时会考虑轨道和车卡的维护、车站操作和人员配套等多个因素。但按照初步估算，广深港高铁香港段在５０年的运营周期内不会亏本，并会有健康的财务回报。