国家发改委的批复指出，为支持南京江北新区建设，落实城市公交优先发展战略，发挥轨道交通网络效益，构建综合交通运输体系，同意对南京市城市轨道交通第二期建设规划确定的建设任务及目标进行调整。调整内容包括新增4号线二期工程、11号线一期工程和S8线南延工程，原二期规划的其余批复内容不变。
根据调整方案，4号线二期工程自龙江至珍珠泉站，投资78.95亿元，规划建设期为2016—2020年。11号线一期工程自马骡圩至浦州路站，投资181.71亿元，规划建设期为2017—2021年。S8线南延工程自泰山新村至大桥站，投资17.11亿元，规划建设期为2017—2020年。4号线二期、S8线南延均采用最高运行时速100公里的B型车，其中4号线二期采用6辆编组，S8线南延采用4辆编组；而11号线一期则采用最高运行时速80公里的A型车6辆编组。
新增的三条地铁线总投资为277.78亿元，其中资本金占20%，计55.56亿元，由南京市财政资金解决，资本金以外的资金以银行贷款为主，并辅以多元化融资。批复还要求，结合南京市城市总体规划、江北新区规划，进一步落实调整新增项目的建设用地，深化研究4号线二期工程江心洲岛设置车站的可行性和必要性，确保工程建设和运营安全。同时做好主城区和江北新区轨道交通线网融合工作，做好轨道交通与其他公共交通方式的衔接换乘，促进城市交通一体化发展。
今年7月，南京地铁纳入“十三五”规划的8条线路已获国家发改委批复，分别是1号线北延线、2号线西延线、3号线三期、10号线二期、5号线、6号线、7号线、9号线一期。目前5号线建宁路试验段已开建、7号线进入勘测阶段，其余6条线路前期方案也于今年年初启动。此外，4号线一期工程将于明年春节前后通车，宁高城际二期、宁溧城际正在紧锣密鼓建设中，将于2018年通车。如今，再加上刚刚获批的3条地铁线，待“十三五”规划的地铁线路全部建成后，预计南京轨道交通线网规模将突破500公里。
S8号线南延
（线路长2.5公里，设站2座）
4号线二期
（线路长9.7公里，设站6座）
11号线一期
（线路长27公里，设站20座）
